加工中心與數控銑床大的差異表現在刀庫及其換刀裝置。加工中心刀庫的常見形式有:圓盤式刀庫、斗笠式刀庫和鏈式刀庫。加工中心的換刀方式有機械手換刀與主軸換刀兩種。圓盤式刀庫和鏈式刀庫一般采用機械手換刀，而斗笠式刀庫一般采用主軸換刀。
刀庫中刀具的選刀方式有順序選刀與任意選刀兩種，前者是將加工所需要的刀具按照預先確定的加工順序依次安裝在刀座中，換刀時，刀庫按順序轉位，這種方式的控制及刀庫運動簡單，但靈活性差，近年來已經不常采用。后者主要是對刀庫中的刀座進行編碼，數控機床根據編碼地址選刀，這種方式應用廣泛。
任意選刀刀庫按刀具編碼方式的不同又分為固定地址換刀刀庫和隨機地址換刀刀庫兩類。固定地址刀庫中刀具存放位里與刀座號相同且固定，從刀庫中取出的刀具使用后仍還回到原來刀座，刀具號與刀座號始終一致，操作者可隨時了解刀庫中的裝刀情況，可以根據刀具在刀庫中的分布直接編寫加工程序中的T指令。斗笠式刀庫多采用固定地址選刀方式。隨機地址刀庫中存放刀具的刀號和刀座號，所以系統設置有一個刀具表，存放刀具號與對應的刀座號的關系。每次換刀動作后.刀具號放入刀座號的關系是變化的，但這種變化記憶在刀具表中.選刀指令可根據刀具表中刀具所對應的刀座號進行選刀(注意程序中的選刀指令仍然指令刀具號)。此外，操作者還能隨時查詢刀具表，必耍時還能編輯和修改刀其表。圓盤式和鏈式刀庫多采用隨機地址選刀方式。
斗笠式刀庫一般較小，可手工直接將刀具裝入刀庫中相應的刀座上。但大部分刀庫的裝刀是借助于主軸手工裝刀，然后通過換刀指令將其裝入刀庫。裝刀操作如下:
1)先執行TxxM06,  x x為欲換的刀具號。
2)手動將x x號刀共裝到主軸上。
重復上面的操作，可以繼續裝刀。
加工中心的換刀過程一般包括兩個動作—選刀與換刀，分別對應刀典指令Tx x和換刀指令M06.選刀和換刀可以在一個程序段完成，也可以分散在不同的程序段完成，后者可以提高工作效率。
應當注意的是，加工中心的刀庫一般由專業廠家生產，其選刀與換刀方式及指令格式取決于刀庫廠家以及機床廠家的設計，因此，刀庫的選刀與換刀方式必須以機床廠家的操作手冊為準。
加工中心的換刀位置一般較為固定.如設置在Z軸的參考點位置(可用G28指令返回)，也有專門設置的位置(一般用G30指令返回)。